Posts Tagged: transpozony

Wyjście z Afryki okiem transpozonu

Transpozony jako obszary potencjalnie zmienne w genomie człowieka również mogą posłużyć do rekonstrukcji ewolucji populacji ludzkich. Takie badanie na 2500 genomach przeprowadzono uwzględniając polimorfizmy w różnych grupach transpozonów. Zgodnie z oczekiwaniem największe zróżnicowanie obserwowano wśród reprezentantów populacji Afryki potwierdzając obowiązującą

Wyjście z Afryki okiem transpozonu

Transpozony jako obszary potencjalnie zmienne w genomie człowieka również mogą posłużyć do rekonstrukcji ewolucji populacji ludzkich. Takie badanie na 2500 genomach przeprowadzono uwzględniając polimorfizmy w różnych grupach transpozonów. Zgodnie z oczekiwaniem największe zróżnicowanie obserwowano wśród reprezentantów populacji Afryki potwierdzając obowiązującą

Retrotranspozony omijają geny kierując się widełkami replikacyjnymi

Przynajmniej u Schizosaccharomyces pombe, jeden z retrotranspozonów oddziałuje bezpośrednio z białkiem Sap1 wiążącym DNA, które uczestniczy w blokowaniu widełek replikacyjnych. Celowanie w obszary promotorowe pozwala na „oszczędzenie” gospodarza i zwiększenie własnych szans na przeżycie, nielosowe wstawianie transpozonów było już dokumentowane

Retrotranspozony omijają geny kierując się widełkami replikacyjnymi

Przynajmniej u Schizosaccharomyces pombe, jeden z retrotranspozonów oddziałuje bezpośrednio z białkiem Sap1 wiążącym DNA, które uczestniczy w blokowaniu widełek replikacyjnych. Celowanie w obszary promotorowe pozwala na „oszczędzenie” gospodarza i zwiększenie własnych szans na przeżycie, nielosowe wstawianie transpozonów było już dokumentowane

Konwergencja na poziomie genomu – ośmiornica

Genom ośmiornicy nie tylko jest podobnej wielkości do genomów kręgowców, koduje również około 30 tysięcy genów, niespotykaną u bezkręgowców liczbę protocadheryn, czynników transkrypcyjnych z palcami cynkowymi C2H2 oraz liczne elementy mobilne zaangażowane w przemodelowanie genomu. Ekspansja TF z C2H2 była

Konwergencja na poziomie genomu – ośmiornica

Genom ośmiornicy nie tylko jest podobnej wielkości do genomów kręgowców, koduje również około 30 tysięcy genów, niespotykaną u bezkręgowców liczbę protocadheryn, czynników transkrypcyjnych z palcami cynkowymi C2H2 oraz liczne elementy mobilne zaangażowane w przemodelowanie genomu. Ekspansja TF z C2H2 była

Transpozony a ciąża

  Innowacja biologiczna jaką jest ciąża ssaków wymaga zaangażowania tysięcy genów, w tym rozwinięcia tolerancji układu odpornościowego. No i tu przyszły z pomocą stare ewolucyjnie transpozony tworząc obszary regulatorowe, które zostały wykorzystane do zgrania regulacji genów zaangażowanych m.in. w kontrolę

Transpozony a ciąża

  Innowacja biologiczna jaką jest ciąża ssaków wymaga zaangażowania tysięcy genów, w tym rozwinięcia tolerancji układu odpornościowego. No i tu przyszły z pomocą stare ewolucyjnie transpozony tworząc obszary regulatorowe, które zostały wykorzystane do zgrania regulacji genów zaangażowanych m.in. w kontrolę

Wielkie nic z ciekawego genomu (S. in S. out)

Nałogowo przeglądam publikacje genomowe dziwnych stworzeń, więc musiałam zajrzeć do genomu najbardziej zimnolubnego grzyba a tam wielkie nic, ogłaszane z resztą w tytule. Przyznaję, że nie przypominam sobie, żeby nie było nic ciekawego w dowolnym grzybowym genomie, czasem trzeba było

Wielkie nic z ciekawego genomu (S. in S. out)

Nałogowo przeglądam publikacje genomowe dziwnych stworzeń, więc musiałam zajrzeć do genomu najbardziej zimnolubnego grzyba a tam wielkie nic, ogłaszane z resztą w tytule. Przyznaję, że nie przypominam sobie, żeby nie było nic ciekawego w dowolnym grzybowym genomie, czasem trzeba było

Odszedł Jerzy Jurka

Niecierpliwie buszując w sieci w poszukiwaniu ogłoszenia o kolejnej konferencji Genomic Impact of Eukaryotic Transposable Elements trafiłam na nekrolog Jerzego Jurki. Miałam niezwykłą przyjemość uczestniczyc w dwóch z trzech edycji tych spotkań, które organizował dwuosobowy tandem złożony właśnie z  Jerzego

Odszedł Jerzy Jurka

Niecierpliwie buszując w sieci w poszukiwaniu ogłoszenia o kolejnej konferencji Genomic Impact of Eukaryotic Transposable Elements trafiłam na nekrolog Jerzego Jurki. Miałam niezwykłą przyjemość uczestniczyc w dwóch z trzech edycji tych spotkań, które organizował dwuosobowy tandem złożony właśnie z  Jerzego

Transpozony sterują ewolucją gibbonów

Kiedy w 2012 słyszałam Lucię Carbone mówiącą o szalonych kariotypach gibbonów, wiadomo było, że mają one specyficzne złożone transpozony LAVA oraz że gibbon od gibbona różni się dramatycznie liczbą chromosomów. Teraz komplet wyników trafił do Nature i okazuje się, że

Transpozony sterują ewolucją gibbonów

Kiedy w 2012 słyszałam Lucię Carbone mówiącą o szalonych kariotypach gibbonów, wiadomo było, że mają one specyficzne złożone transpozony LAVA oraz że gibbon od gibbona różni się dramatycznie liczbą chromosomów. Teraz komplet wyników trafił do Nature i okazuje się, że