Posts Tagged: genom

translesion DNA polymerases – nowy element w erozji genomów

Dotychczas sądzono, że redukcji i erozji genomów towarzyszy stoponiowe tracenie mechanizmów naprawczych DNA, ekspansja elementów mobilnych. Erozji genomów miała sprzyjać mała efektywna wielkość populacji. Genom Polynucleobacter necessarius był prawdopodobnie zredukowany już u przodka, współcześni reprezentanci taksonu bywają wolnożyjący lub symbiotyczni.

translesion DNA polymerases – nowy element w erozji genomów

Dotychczas sądzono, że redukcji i erozji genomów towarzyszy stoponiowe tracenie mechanizmów naprawczych DNA, ekspansja elementów mobilnych. Erozji genomów miała sprzyjać mała efektywna wielkość populacji. Genom Polynucleobacter necessarius był prawdopodobnie zredukowany już u przodka, współcześni reprezentanci taksonu bywają wolnożyjący lub symbiotyczni.

System restrykcji i modyfikacji do rearanżacji genomu!

Genom endosymbionta (w tym wewnątrzkomórkowych bakterii) ulega stopniowej redukcji w czasie dostosowywania się do życia wewnątrz gospodarza. Do tej pory wiadomo było, że za przetasowanie genomu endosymbionta odpowiadają między innymi elementy mobilne, w tym transpozony. Okazuje się, że za takie

System restrykcji i modyfikacji do rearanżacji genomu!

Genom endosymbionta (w tym wewnątrzkomórkowych bakterii) ulega stopniowej redukcji w czasie dostosowywania się do życia wewnątrz gospodarza. Do tej pory wiadomo było, że za przetasowanie genomu endosymbionta odpowiadają między innymi elementy mobilne, w tym transpozony. Okazuje się, że za takie

Ceratium sp. by @myfwc

Symbiotyczne bruzdnice w tandemie z koralowcami

Ogromny genom bruzdnicy Symbiodinium kawagutii  zawiera liczne ekspansje rodzin białkowych, elementów mobilnych oraz miRNA. Co ciekawe sekwencje miRNA odpowiadają genom gospodarza. Genom bruzdnicy koduje enzymy umożliwiające syntezę tych aminokwasów, których nie umie wytwarzać koralowiec. Oba genomy mają dopasowany zestaw transporterów

Ceratium sp. by @myfwc

Symbiotyczne bruzdnice w tandemie z koralowcami

Ogromny genom bruzdnicy Symbiodinium kawagutii  zawiera liczne ekspansje rodzin białkowych, elementów mobilnych oraz miRNA. Co ciekawe sekwencje miRNA odpowiadają genom gospodarza. Genom bruzdnicy koduje enzymy umożliwiające syntezę tych aminokwasów, których nie umie wytwarzać koralowiec. Oba genomy mają dopasowany zestaw transporterów

Efekt diety Inuitów – widoczny w genomie

Badania genomów mieszkańców Grenlandii wykazały dostosowania do diety bogatej w tłuszcze zwierzęce wpływające zarówno na wzrost jak i wagę Inuitów oraz prawdopodobnie na poziom cholesterolu. (Science)

Efekt diety Inuitów – widoczny w genomie

Badania genomów mieszkańców Grenlandii wykazały dostosowania do diety bogatej w tłuszcze zwierzęce wpływające zarówno na wzrost jak i wagę Inuitów oraz prawdopodobnie na poziom cholesterolu. (Science)

W głodzie upakuj telomery

Okazuje się, że drożdże w stresie reorganizują swoją chromatynę lokując w centrum komórki telomery i chroniąc je przed stresem. Mutanty z uszkodzonym systemem wyciszania telomerów gorzej radziły sobie z przeczekaniem głodu (Genome Biol)

W głodzie upakuj telomery

Okazuje się, że drożdże w stresie reorganizują swoją chromatynę lokując w centrum komórki telomery i chroniąc je przed stresem. Mutanty z uszkodzonym systemem wyciszania telomerów gorzej radziły sobie z przeczekaniem głodu (Genome Biol)

Retrotranspozony omijają geny kierując się widełkami replikacyjnymi

Przynajmniej u Schizosaccharomyces pombe, jeden z retrotranspozonów oddziałuje bezpośrednio z białkiem Sap1 wiążącym DNA, które uczestniczy w blokowaniu widełek replikacyjnych. Celowanie w obszary promotorowe pozwala na „oszczędzenie” gospodarza i zwiększenie własnych szans na przeżycie, nielosowe wstawianie transpozonów było już dokumentowane

Retrotranspozony omijają geny kierując się widełkami replikacyjnymi

Przynajmniej u Schizosaccharomyces pombe, jeden z retrotranspozonów oddziałuje bezpośrednio z białkiem Sap1 wiążącym DNA, które uczestniczy w blokowaniu widełek replikacyjnych. Celowanie w obszary promotorowe pozwala na „oszczędzenie” gospodarza i zwiększenie własnych szans na przeżycie, nielosowe wstawianie transpozonów było już dokumentowane

Konwergencja na poziomie genomu – ośmiornica

Genom ośmiornicy nie tylko jest podobnej wielkości do genomów kręgowców, koduje również około 30 tysięcy genów, niespotykaną u bezkręgowców liczbę protocadheryn, czynników transkrypcyjnych z palcami cynkowymi C2H2 oraz liczne elementy mobilne zaangażowane w przemodelowanie genomu. Ekspansja TF z C2H2 była

Konwergencja na poziomie genomu – ośmiornica

Genom ośmiornicy nie tylko jest podobnej wielkości do genomów kręgowców, koduje również około 30 tysięcy genów, niespotykaną u bezkręgowców liczbę protocadheryn, czynników transkrypcyjnych z palcami cynkowymi C2H2 oraz liczne elementy mobilne zaangażowane w przemodelowanie genomu. Ekspansja TF z C2H2 była