Posts Tagged: genom

Każdy gen na innym chromosomie

Szalone rozwiązania dotyczące organizacji genomów to klasyk u orzęsków, mają dwa rodzaje jąder komórkowych (mikro- i makronukleus), używają udomowionej transpozazy do utrzymywania swojego materiału genetycznego. Tym razem opisano genom Uroleptopsis citrina, który lubi mieć inne stop kodony niż reszta świata

Każdy gen na innym chromosomie

Szalone rozwiązania dotyczące organizacji genomów to klasyk u orzęsków, mają dwa rodzaje jąder komórkowych (mikro- i makronukleus), używają udomowionej transpozazy do utrzymywania swojego materiału genetycznego. Tym razem opisano genom Uroleptopsis citrina, który lubi mieć inne stop kodony niż reszta świata

Wrotki bardziej zachowawcze niż sądzono

Wrotki były przez lata uważane za anarchistów ewolucji, nie dość że seksu nie mają (rozmnażania płciowego brak) to tak bezkarnie sobie wysychają i odżywają po namoczeniu, braki w uzębieniu, tfu w DNA uzupełniają cudzym DNA bez najmniejszego zawahania i  w

Wrotki bardziej zachowawcze niż sądzono

Wrotki były przez lata uważane za anarchistów ewolucji, nie dość że seksu nie mają (rozmnażania płciowego brak) to tak bezkarnie sobie wysychają i odżywają po namoczeniu, braki w uzębieniu, tfu w DNA uzupełniają cudzym DNA bez najmniejszego zawahania i  w

Alu kierują lncRNA do jądra

Udział elementów mobilnych w tworzeniu misternie zarządzanej całości jaką jest genom (a w konsekwencji żywa komórka) nie przestaje zaskakiwać. Otóż sekwencje pochodzące z Alu (krótkich ludzkich retrotranspozonów SINE) są obecne w długich niekodujących RNA i decydują o ich transporcie do

Alu kierują lncRNA do jądra

Udział elementów mobilnych w tworzeniu misternie zarządzanej całości jaką jest genom (a w konsekwencji żywa komórka) nie przestaje zaskakiwać. Otóż sekwencje pochodzące z Alu (krótkich ludzkich retrotranspozonów SINE) są obecne w długich niekodujących RNA i decydują o ich transporcie do

Zwierzęcość przed wielokomórkowością

Porównawcze badania genomów zwierząt i ich jednokomórkowych krewniaków pozwoliły na ustalenie, że jednokomórkowi przodkowie zwierząt doświadczyli masowej duplikacji genów związanych z przyleganiem i czynników transkrypcyjnych, nabyli nowe introny i zwiększyli złożoność genomu uzyskując typową dla zwierząt architekturę genomu zanim wykształcili

Zwierzęcość przed wielokomórkowością

Porównawcze badania genomów zwierząt i ich jednokomórkowych krewniaków pozwoliły na ustalenie, że jednokomórkowi przodkowie zwierząt doświadczyli masowej duplikacji genów związanych z przyleganiem i czynników transkrypcyjnych, nabyli nowe introny i zwiększyli złożoność genomu uzyskując typową dla zwierząt architekturę genomu zanim wykształcili

Ewolucja wielkości genomów u zwierząt

Jedne genomy są duże inne małe. Zakładano, że u ssaków nie dzieje się wiele ciekawego w zakresie ewolucji genomów, i że mają one mniej więcej określone rozmiary. Okazuje się, że nawet jeśli rozmiar genomu ustalił się dość dawno temu (z

Ewolucja wielkości genomów u zwierząt

Jedne genomy są duże inne małe. Zakładano, że u ssaków nie dzieje się wiele ciekawego w zakresie ewolucji genomów, i że mają one mniej więcej określone rozmiary. Okazuje się, że nawet jeśli rozmiar genomu ustalił się dość dawno temu (z

translesion DNA polymerases – nowy element w erozji genomów

Dotychczas sądzono, że redukcji i erozji genomów towarzyszy stoponiowe tracenie mechanizmów naprawczych DNA, ekspansja elementów mobilnych. Erozji genomów miała sprzyjać mała efektywna wielkość populacji. Genom Polynucleobacter necessarius był prawdopodobnie zredukowany już u przodka, współcześni reprezentanci taksonu bywają wolnożyjący lub symbiotyczni.

translesion DNA polymerases – nowy element w erozji genomów

Dotychczas sądzono, że redukcji i erozji genomów towarzyszy stoponiowe tracenie mechanizmów naprawczych DNA, ekspansja elementów mobilnych. Erozji genomów miała sprzyjać mała efektywna wielkość populacji. Genom Polynucleobacter necessarius był prawdopodobnie zredukowany już u przodka, współcześni reprezentanci taksonu bywają wolnożyjący lub symbiotyczni.

System restrykcji i modyfikacji do rearanżacji genomu!

Genom endosymbionta (w tym wewnątrzkomórkowych bakterii) ulega stopniowej redukcji w czasie dostosowywania się do życia wewnątrz gospodarza. Do tej pory wiadomo było, że za przetasowanie genomu endosymbionta odpowiadają między innymi elementy mobilne, w tym transpozony. Okazuje się, że za takie

System restrykcji i modyfikacji do rearanżacji genomu!

Genom endosymbionta (w tym wewnątrzkomórkowych bakterii) ulega stopniowej redukcji w czasie dostosowywania się do życia wewnątrz gospodarza. Do tej pory wiadomo było, że za przetasowanie genomu endosymbionta odpowiadają między innymi elementy mobilne, w tym transpozony. Okazuje się, że za takie

Ceratium sp. by @myfwc

Symbiotyczne bruzdnice w tandemie z koralowcami

Ogromny genom bruzdnicy Symbiodinium kawagutii  zawiera liczne ekspansje rodzin białkowych, elementów mobilnych oraz miRNA. Co ciekawe sekwencje miRNA odpowiadają genom gospodarza. Genom bruzdnicy koduje enzymy umożliwiające syntezę tych aminokwasów, których nie umie wytwarzać koralowiec. Oba genomy mają dopasowany zestaw transporterów

Ceratium sp. by @myfwc

Symbiotyczne bruzdnice w tandemie z koralowcami

Ogromny genom bruzdnicy Symbiodinium kawagutii  zawiera liczne ekspansje rodzin białkowych, elementów mobilnych oraz miRNA. Co ciekawe sekwencje miRNA odpowiadają genom gospodarza. Genom bruzdnicy koduje enzymy umożliwiające syntezę tych aminokwasów, których nie umie wytwarzać koralowiec. Oba genomy mają dopasowany zestaw transporterów

Efekt diety Inuitów – widoczny w genomie

Badania genomów mieszkańców Grenlandii wykazały dostosowania do diety bogatej w tłuszcze zwierzęce wpływające zarówno na wzrost jak i wagę Inuitów oraz prawdopodobnie na poziom cholesterolu. (Science)

Efekt diety Inuitów – widoczny w genomie

Badania genomów mieszkańców Grenlandii wykazały dostosowania do diety bogatej w tłuszcze zwierzęce wpływające zarówno na wzrost jak i wagę Inuitów oraz prawdopodobnie na poziom cholesterolu. (Science)

W głodzie upakuj telomery

Okazuje się, że drożdże w stresie reorganizują swoją chromatynę lokując w centrum komórki telomery i chroniąc je przed stresem. Mutanty z uszkodzonym systemem wyciszania telomerów gorzej radziły sobie z przeczekaniem głodu (Genome Biol)

W głodzie upakuj telomery

Okazuje się, że drożdże w stresie reorganizują swoją chromatynę lokując w centrum komórki telomery i chroniąc je przed stresem. Mutanty z uszkodzonym systemem wyciszania telomerów gorzej radziły sobie z przeczekaniem głodu (Genome Biol)