Sterylne życie w laboratorium słabo modeluje rzeczywistość

Nature jako czasopismo dość konserwatywne przyjmuje czasem groteskowa rolę mówienia na głos tego, co każdy użytkownik rozumu wie (link). Tym razem tygodnik publikuje sensacyjną sensację, mianowicie życie w sterylnym laboratorium średnio oddaje rzeczywistość na poziomie makro (wygląda nieco inaczej niż

Sterylne życie w laboratorium słabo modeluje rzeczywistość

Nature jako czasopismo dość konserwatywne przyjmuje czasem groteskowa rolę mówienia na głos tego, co każdy użytkownik rozumu wie (link). Tym razem tygodnik publikuje sensacyjną sensację, mianowicie życie w sterylnym laboratorium średnio oddaje rzeczywistość na poziomie makro (wygląda nieco inaczej niż

Sieć neuronowa zupełnie jak komórka

W Nature został opublikowany model sieci neuronowej, która odtwarza działanie komórki eukaryotycznej.  Sieć zostąła wytrenowana na drożdżowych danych eksperymentalnych obejmujących również interakcje genetyczne. Efekt uczenia jest imponujący i obejmuje zarówno strukturę wewnątrzkomórkowych relacji jak i funkcje poszczególnych szlaków/procesów/składowych komórki. Uzyskiwane

Sieć neuronowa zupełnie jak komórka

W Nature został opublikowany model sieci neuronowej, która odtwarza działanie komórki eukaryotycznej.  Sieć zostąła wytrenowana na drożdżowych danych eksperymentalnych obejmujących również interakcje genetyczne. Efekt uczenia jest imponujący i obejmuje zarówno strukturę wewnątrzkomórkowych relacji jak i funkcje poszczególnych szlaków/procesów/składowych komórki. Uzyskiwane

Alu kierują lncRNA do jądra

Udział elementów mobilnych w tworzeniu misternie zarządzanej całości jaką jest genom (a w konsekwencji żywa komórka) nie przestaje zaskakiwać. Otóż sekwencje pochodzące z Alu (krótkich ludzkich retrotranspozonów SINE) są obecne w długich niekodujących RNA i decydują o ich transporcie do

Alu kierują lncRNA do jądra

Udział elementów mobilnych w tworzeniu misternie zarządzanej całości jaką jest genom (a w konsekwencji żywa komórka) nie przestaje zaskakiwać. Otóż sekwencje pochodzące z Alu (krótkich ludzkich retrotranspozonów SINE) są obecne w długich niekodujących RNA i decydują o ich transporcie do

Bakterie jeżdzą grzybową autostradą

Już nie tylko grzybowa sieć telekomunikacyjna łączy rośliny 🙂 okazuje się, że ścieżki wytyczone przez grzyba mogą służyć za drogę dla rozprzestrzegania się ruchliwych bakterii. Przeprowadzone eksperymetny wykazały, że bakterie rozptrzestrzeniają się w płynnej warstwie na powierzchni strzępek grzyba rosnących

Bakterie jeżdzą grzybową autostradą

Już nie tylko grzybowa sieć telekomunikacyjna łączy rośliny 🙂 okazuje się, że ścieżki wytyczone przez grzyba mogą służyć za drogę dla rozprzestrzegania się ruchliwych bakterii. Przeprowadzone eksperymetny wykazały, że bakterie rozptrzestrzeniają się w płynnej warstwie na powierzchni strzępek grzyba rosnących

Otwarte dane, publikacje i notesy

W PLoS Biology ukazał się artykuł promujący otwartość w nauce. Autorka przestawia m.in. 10 rad, których powszechne stosowanie wpłynełoby na wzrost otwartości w świecie akademickim. Poleca publikowanie wyłącznie w otwartym dostępie, umieszczanie artykułów jako pre-prints w stosownych portalach, dzielenie się

Otwarte dane, publikacje i notesy

W PLoS Biology ukazał się artykuł promujący otwartość w nauce. Autorka przestawia m.in. 10 rad, których powszechne stosowanie wpłynełoby na wzrost otwartości w świecie akademickim. Poleca publikowanie wyłącznie w otwartym dostępie, umieszczanie artykułów jako pre-prints w stosownych portalach, dzielenie się

Zwierzęcość przed wielokomórkowością

Porównawcze badania genomów zwierząt i ich jednokomórkowych krewniaków pozwoliły na ustalenie, że jednokomórkowi przodkowie zwierząt doświadczyli masowej duplikacji genów związanych z przyleganiem i czynników transkrypcyjnych, nabyli nowe introny i zwiększyli złożoność genomu uzyskując typową dla zwierząt architekturę genomu zanim wykształcili

Zwierzęcość przed wielokomórkowością

Porównawcze badania genomów zwierząt i ich jednokomórkowych krewniaków pozwoliły na ustalenie, że jednokomórkowi przodkowie zwierząt doświadczyli masowej duplikacji genów związanych z przyleganiem i czynników transkrypcyjnych, nabyli nowe introny i zwiększyli złożoność genomu uzyskując typową dla zwierząt architekturę genomu zanim wykształcili

Ewolucja wielkości genomów u zwierząt

Jedne genomy są duże inne małe. Zakładano, że u ssaków nie dzieje się wiele ciekawego w zakresie ewolucji genomów, i że mają one mniej więcej określone rozmiary. Okazuje się, że nawet jeśli rozmiar genomu ustalił się dość dawno temu (z

Ewolucja wielkości genomów u zwierząt

Jedne genomy są duże inne małe. Zakładano, że u ssaków nie dzieje się wiele ciekawego w zakresie ewolucji genomów, i że mają one mniej więcej określone rozmiary. Okazuje się, że nawet jeśli rozmiar genomu ustalił się dość dawno temu (z