Artefakty w transkryptomach źródłem >50% trans-splicingów

W NAR ukazał się artykuł tłumaczący pochodzenie i weryfikację dla ludzkich transkryptów obejmująch obszary, które nie sąsiadują w genomie (post-transcriptionally non-co-linear (‚PtNcl’)) opublikowane w ramach ENCODE. Okazuje się, że RT-PCR nie jest wystarczającym potwierdzeniem i wiele z tych transkryptów to artefakty, co ciekawsze cyrkularyzacja RNA i trans-splicing mogą być źródłem takich samych transkryptów. Ogółem ponad połowa analizowanych transkryptów PtNcl występuje raczej in vitro niż in vivo. Te autentyczne trans-splicingi i koliste RNA są zachowanie u spokrewnionych organizmów.

Advertisements

Skomentuj

Wprowadź swoje dane lub kliknij jedną z tych ikon, aby się zalogować:

Logo WordPress.com

Komentujesz korzystając z konta WordPress.com. Log Out / Zmień )

Zdjęcie z Twittera

Komentujesz korzystając z konta Twitter. Log Out / Zmień )

Facebook photo

Komentujesz korzystając z konta Facebook. Log Out / Zmień )

Google+ photo

Komentujesz korzystając z konta Google+. Log Out / Zmień )

Connecting to %s

%d blogerów lubi to: